Östrojen kullanan kadınlarda bunun kesilmesi migren ağrılarını tetikleyebilmektedir. Östrojende ani düşüşün buna neden olduğu düşünülmektedir. Sirkadiyen ritm bozukluğu ve düzensiz uyuma migreni tetikler. Menstruasyon sırasında migren atakları olanlar menapoz sonrası östrojen aldıklarında migren olabilmektedir.
Sabah güneş görmek baş ağrısına iyi gelir. Progesteron kesilince baş ağrısı olmaz. Yapıştırma tarzı östrojende bu daha az olmaktadır. Kronik migreni olanların çoğunda uyku apnesi saptanmıştır.
Melatonin hormonu ile migren arasında ilişki bulunmuştur. Melatoninin migren ataklarını azaltmayla ilgili çalışmalar vardır.